MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0132.1 Pdx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 31 E= 0 0.032258 0.612903 0.161290 0.193548 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.032258 0.967742 0.032258 0.032258 0.322581 0.612903 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0132.1 MOTIF PH0081.1 Pdx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.290000 0.200000 0.130000 0.346535 0.247525 0.207921 0.198020 0.380000 0.070000 0.460000 0.090000 0.080808 0.272727 0.474747 0.171717 0.010000 0.090000 0.000000 0.900000 0.890000 0.100000 0.010000 0.000000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.100000 0.890000 0.900000 0.000000 0.090000 0.010000 0.118812 0.207921 0.564356 0.108911 0.090000 0.460000 0.070000 0.380000 0.343434 0.202020 0.070707 0.383838 0.171717 0.505051 0.191919 0.131313 0.690000 0.030000 0.140000 0.140000 0.222222 0.181818 0.232323 0.363636 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0081.1 MOTIF PH0135.1 Phox2a letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.320000 0.230000 0.280000 0.297030 0.217822 0.277228 0.207921 0.210000 0.240000 0.300000 0.250000 0.303030 0.383838 0.080808 0.232323 0.680000 0.120000 0.150000 0.050000 0.030000 0.350000 0.020000 0.600000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.020202 0.979798 0.880000 0.010000 0.100000 0.010000 0.287129 0.039604 0.594059 0.079208 0.050000 0.250000 0.210000 0.490000 0.330000 0.180000 0.330000 0.160000 0.257426 0.277228 0.386139 0.079208 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0135.1 MOTIF PH0136.1 Phox2b letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.270000 0.380000 0.280000 0.070000 0.310000 0.200000 0.360000 0.130000 0.170000 0.220000 0.310000 0.300000 0.606061 0.151515 0.090909 0.151515 0.580000 0.200000 0.200000 0.020000 0.050505 0.151515 0.010101 0.787879 0.020000 0.040000 0.000000 0.940000 0.970000 0.010000 0.020000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.020000 0.010000 0.970000 0.940000 0.000000 0.040000 0.020000 0.787879 0.010101 0.151515 0.050505 0.060000 0.320000 0.230000 0.390000 0.380000 0.090000 0.290000 0.240000 0.207921 0.277228 0.297030 0.217822 0.161616 0.171717 0.505051 0.161616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0136.1 MOTIF MA0681.1 Phox2b letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29284 E= 0 0.123071 0.058394 0.020865 0.797671 0.851400 0.009841 0.096807 0.041952 0.996077 0.001066 0.002686 0.000171 0.050523 0.262326 0.025629 0.661522 0.032161 0.369132 0.181181 0.417525 0.109420 0.362824 0.075030 0.452727 0.796665 0.037857 0.144879 0.020600 0.970501 0.008891 0.016370 0.004238 0.000000 0.000385 0.000000 0.999615 0.058112 0.043373 0.001919 0.896595 0.847108 0.007325 0.039964 0.105603 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0681.1 MOTIF PH0137.1 Pitx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.207921 0.247525 0.168317 0.376238 0.120000 0.170000 0.350000 0.360000 0.440000 0.190000 0.290000 0.080000 0.280000 0.150000 0.420000 0.150000 0.450000 0.050000 0.390000 0.110000 0.191919 0.040404 0.737374 0.030303 0.040404 0.000000 0.959596 0.000000 0.009901 0.000000 0.980198 0.009901 0.960000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.919192 0.000000 0.000000 0.080808 0.720000 0.020000 0.200000 0.060000 0.330000 0.490000 0.060000 0.120000 0.460000 0.070000 0.240000 0.230000 0.480000 0.210000 0.140000 0.170000 0.260000 0.250000 0.200000 0.290000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0137.1 MOTIF MA0682.1 Pitx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3115 E= 0 0.192616 0.270305 0.108507 0.428571 0.049076 0.006968 0.000000 0.943956 0.882720 0.043909 0.059490 0.013881 0.994574 0.000000 0.000000 0.005426 0.018858 0.015894 0.125808 0.839440 0.061411 0.861964 0.011618 0.065007 0.040695 0.773201 0.034243 0.151861 0.228177 0.409178 0.137997 0.224647 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0682.1 MOTIF PH0138.1 Pitx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.230000 0.260000 0.270000 0.240000 0.080000 0.410000 0.270000 0.390000 0.130000 0.220000 0.260000 0.460000 0.170000 0.270000 0.100000 0.290000 0.100000 0.560000 0.050000 0.110000 0.000000 0.890000 0.000000 0.010000 0.000000 0.980000 0.010000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.900000 0.000000 0.000000 0.100000 0.700000 0.040000 0.190000 0.070000 0.090909 0.161616 0.090909 0.656566 0.260000 0.320000 0.110000 0.310000 0.380000 0.130000 0.250000 0.240000 0.280000 0.170000 0.210000 0.340000 0.190000 0.430000 0.100000 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0138.1 MOTIF PH0139.1 Pitx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.230000 0.320000 0.070000 0.191919 0.131313 0.545455 0.131313 0.069307 0.227723 0.643564 0.059406 0.170000 0.030000 0.760000 0.040000 0.020000 0.000000 0.980000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.960000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.980000 0.000000 0.000000 0.020000 0.180000 0.040000 0.540000 0.240000 0.050000 0.770000 0.120000 0.060000 0.160000 0.160000 0.220000 0.460000 0.340000 0.140000 0.360000 0.160000 0.151515 0.343434 0.333333 0.171717 0.128713 0.544554 0.198020 0.128713 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0139.1 MOTIF PH0140.1 Pknox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.435644 0.089109 0.168317 0.306931 0.434343 0.060606 0.363636 0.141414 0.323232 0.282828 0.212121 0.181818 0.050000 0.290000 0.520000 0.140000 0.929293 0.010101 0.040404 0.020202 0.040000 0.580000 0.340000 0.040000 0.020000 0.970000 0.010000 0.000000 0.000000 0.030000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.020000 0.010000 0.000000 0.970000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.673267 0.079208 0.039604 0.207921 0.330000 0.110000 0.070000 0.490000 0.287129 0.415842 0.188119 0.108911 0.202020 0.474747 0.171717 0.151515 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0140.1