MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1252.1 PUCHI letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 478 E= 0 0.179916 0.512552 0.096234 0.211297 0.175732 0.533473 0.054393 0.236402 0.309623 0.087866 0.313808 0.288703 0.127615 0.531381 0.077406 0.263598 0.081590 0.830544 0.000000 0.087866 0.123431 0.000000 0.535565 0.341004 0.000000 0.830544 0.127615 0.041841 0.002092 0.997908 0.000000 0.000000 0.016736 0.000000 0.981172 0.002092 0.004184 0.974895 0.002092 0.018828 0.006276 0.993724 0.000000 0.000000 0.027197 0.000000 0.960251 0.012552 0.016736 0.543933 0.023013 0.416318 0.217573 0.447699 0.071130 0.263598 0.405858 0.077406 0.257322 0.259414 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1252.1 MOTIF MA0358.1 PUT3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.090909 0.727273 0.090909 0.090909 0.020000 0.900000 0.020000 0.060000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.514851 0.148515 0.188119 0.148515 0.455446 0.128713 0.168317 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0358.1 MOTIF MA0067.1 Pax2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 31 E= 0 0.322581 0.225806 0.161290 0.290323 0.225806 0.032258 0.677419 0.064516 0.096774 0.064516 0.000000 0.838710 0.000000 0.903226 0.032258 0.064516 0.838710 0.032258 0.096774 0.032258 0.064516 0.548387 0.032258 0.354839 0.064516 0.000000 0.612903 0.322581 0.032258 0.354839 0.354839 0.258065 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0067.1 MOTIF MA0068.1 Pax4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 21 E= 0 0.333333 0.095238 0.523810 0.047619 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.761905 0.095238 0.047619 0.095238 0.523810 0.047619 0.047619 0.380952 0.619048 0.047619 0.142857 0.190476 0.523810 0.142857 0.047619 0.285714 0.285714 0.047619 0.095238 0.571429 0.428571 0.047619 0.047619 0.476190 0.238095 0.142857 0.285714 0.333333 0.238095 0.523810 0.047619 0.190476 0.285714 0.523810 0.190476 0.000000 0.333333 0.333333 0.238095 0.095238 0.380952 0.333333 0.095238 0.190476 0.285714 0.238095 0.047619 0.428571 0.476190 0.238095 0.190476 0.095238 0.190476 0.380952 0.190476 0.238095 0.142857 0.285714 0.190476 0.380952 0.333333 0.380952 0.142857 0.142857 0.190476 0.428571 0.142857 0.238095 0.428571 0.285714 0.095238 0.190476 0.238095 0.333333 0.238095 0.190476 0.238095 0.285714 0.095238 0.380952 0.333333 0.523810 0.000000 0.142857 0.285714 0.428571 0.047619 0.238095 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.333333 0.428571 0.095238 0.142857 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.047619 0.523810 0.142857 0.285714 0.285714 0.523810 0.047619 0.142857 0.142857 0.619048 0.095238 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0068.1 MOTIF PH0131.1 Pax4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.420000 0.080000 0.070000 0.430000 0.230000 0.310000 0.330000 0.130000 0.404040 0.181818 0.242424 0.171717 0.370000 0.140000 0.190000 0.300000 0.019802 0.594059 0.019802 0.366337 0.030000 0.010000 0.040000 0.920000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.920000 0.040000 0.010000 0.030000 0.366337 0.019802 0.594059 0.019802 0.110000 0.520000 0.080000 0.290000 0.140000 0.370000 0.230000 0.260000 0.180000 0.440000 0.320000 0.060000 0.340000 0.100000 0.310000 0.250000 0.280000 0.350000 0.180000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0131.1 MOTIF MA0014.1 Pax5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 12 E= 0 0.333333 0.083333 0.333333 0.250000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.250000 0.250000 0.166667 0.083333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.583333 0.166667 0.083333 0.166667 0.166667 0.416667 0.250000 0.166667 0.000000 0.250000 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.666667 0.083333 0.500000 0.083333 0.250000 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.666667 0.083333 0.083333 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.083333 0.000000 0.333333 0.583333 0.500000 0.083333 0.416667 0.000000 0.416667 0.083333 0.416667 0.083333 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0014.1 MOTIF MA0069.1 Pax6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 43 E= 0 0.046512 0.093023 0.093023 0.767442 0.046512 0.046512 0.000000 0.906977 0.093023 0.604651 0.023256 0.279070 0.906977 0.046512 0.023256 0.023256 0.069767 0.790698 0.023256 0.116279 0.023256 0.000000 0.953488 0.023256 0.023256 0.860465 0.093023 0.023256 0.488372 0.046512 0.046512 0.418605 0.023256 0.093023 0.023256 0.860465 0.046512 0.325581 0.581395 0.046512 0.837209 0.000000 0.139535 0.023256 0.255814 0.255814 0.302326 0.186047 0.023256 0.116279 0.069767 0.790698 0.023256 0.000000 0.395349 0.581395 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0069.1 MOTIF PH0132.1 Pax6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.060000 0.150000 0.110000 0.680000 0.260000 0.130000 0.430000 0.180000 0.620000 0.210000 0.100000 0.070000 0.080808 0.404040 0.040404 0.474747 0.120000 0.070000 0.010000 0.800000 0.949495 0.020202 0.020202 0.010101 0.969697 0.010101 0.000000 0.020202 0.020202 0.000000 0.010101 0.969697 0.010101 0.020202 0.020202 0.949495 0.800000 0.010000 0.070000 0.120000 0.514851 0.049505 0.277228 0.158416 0.070000 0.100000 0.210000 0.620000 0.070707 0.080808 0.282828 0.565657 0.257426 0.277228 0.306931 0.158416 0.390000 0.190000 0.200000 0.220000 0.230000 0.410000 0.170000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0132.1 MOTIF PH0133.1 Pax7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.360000 0.140000 0.180000 0.200000 0.230000 0.400000 0.170000 0.414141 0.212121 0.080808 0.292929 0.290000 0.290000 0.210000 0.210000 0.110000 0.440000 0.020000 0.430000 0.060606 0.202020 0.010101 0.727273 0.910000 0.010000 0.080000 0.000000 0.950000 0.000000 0.020000 0.030000 0.030000 0.020000 0.000000 0.950000 0.000000 0.080000 0.010000 0.910000 0.727273 0.010101 0.202020 0.060606 0.430000 0.020000 0.440000 0.110000 0.120000 0.200000 0.290000 0.390000 0.404040 0.212121 0.131313 0.252525 0.310000 0.330000 0.210000 0.150000 0.257426 0.148515 0.267327 0.326733 0.370000 0.190000 0.230000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0133.1 MOTIF PH0134.1 Pbx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.210000 0.280000 0.150000 0.360000 0.060606 0.494949 0.151515 0.292929 0.595960 0.030303 0.141414 0.232323 0.120000 0.400000 0.090000 0.390000 0.370000 0.390000 0.110000 0.130000 0.110000 0.730000 0.090000 0.070000 0.860000 0.020000 0.070000 0.050000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.930000 0.030000 0.020000 0.020000 0.740000 0.060000 0.030000 0.170000 0.310000 0.050000 0.060000 0.580000 0.320000 0.320000 0.150000 0.210000 0.390000 0.140000 0.090000 0.380000 0.356436 0.138614 0.148515 0.356436 0.260000 0.290000 0.240000 0.210000 0.370000 0.350000 0.210000 0.070000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0134.1