MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0714.1 PITX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 6253 E= 0 0.260035 0.307692 0.261315 0.170958 0.184967 0.334719 0.093061 0.387253 0.072436 0.007493 0.001322 0.918748 0.932866 0.004774 0.038789 0.023572 0.997607 0.000000 0.002393 0.000000 0.033789 0.017797 0.141991 0.806422 0.045604 0.896745 0.023806 0.033845 0.029530 0.813451 0.031091 0.125927 0.181993 0.471774 0.155126 0.191108 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0714.1 MOTIF MA0782.1 PKNOX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 19608 E= 0 0.004794 0.011934 0.003723 0.979549 0.001036 0.004281 0.994097 0.000586 0.990132 0.000340 0.008280 0.001248 0.000607 0.998952 0.000000 0.000441 0.997306 0.000168 0.002133 0.000393 0.000988 0.000314 0.945495 0.053203 0.055728 0.454833 0.488132 0.001307 0.000259 0.001813 0.000829 0.997099 0.015636 0.000577 0.983520 0.000267 0.010028 0.005303 0.000473 0.984196 0.001052 0.994407 0.003821 0.000720 0.963325 0.003115 0.010549 0.023010 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0782.1 MOTIF MA0783.1 PKNOX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1238 E= 0 0.029887 0.000000 0.007270 0.962843 0.000716 0.004298 0.994986 0.000000 0.980803 0.002618 0.011344 0.005236 0.000000 0.992851 0.000000 0.007149 0.995741 0.000000 0.000852 0.003407 0.004919 0.000000 0.912157 0.082923 0.037321 0.290909 0.671770 0.000000 0.000000 0.003311 0.000000 0.996689 0.002183 0.000728 0.997089 0.000000 0.008258 0.023947 0.004129 0.963666 0.008560 0.984436 0.004669 0.002335 0.974611 0.000819 0.017199 0.007371 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0783.1 MOTIF MA0163.1 PLAG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.777778 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.777778 0.222222 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.111111 0.222222 0.555556 0.055556 0.166667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0.000000 0.111111 0.000000 0.777778 0.111111 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0163.1 MOTIF MA1377.1 PLT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 195 E= 0 0.153846 0.066667 0.497436 0.282051 0.215385 0.025641 0.569231 0.189744 0.015385 0.876923 0.000000 0.107692 0.748718 0.046154 0.123077 0.082051 0.010256 0.958974 0.015385 0.015385 0.148718 0.020513 0.800000 0.030769 0.302564 0.210256 0.328205 0.158974 0.471795 0.046154 0.082051 0.400000 0.189744 0.102564 0.025641 0.682051 0.220513 0.420513 0.000000 0.358974 0.066667 0.528205 0.005128 0.400000 0.000000 0.989744 0.000000 0.010256 0.241026 0.046154 0.646154 0.066667 0.969231 0.000000 0.030769 0.000000 0.082051 0.046154 0.728205 0.143590 0.389744 0.015385 0.584615 0.010256 0.410256 0.317949 0.051282 0.220513 0.410256 0.143590 0.251282 0.194872 0.369231 0.169231 0.276923 0.184615 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1377.1 MOTIF MA1378.1 PLT3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 531 E= 0 0.020716 0.649718 0.030132 0.299435 0.254237 0.661017 0.024482 0.060264 0.003766 0.045198 0.005650 0.945386 0.062147 0.672316 0.062147 0.203390 0.003766 0.013183 0.973635 0.009416 0.418079 0.000000 0.523540 0.058380 0.314501 0.013183 0.448211 0.224105 0.693032 0.030132 0.086629 0.190207 0.419962 0.045198 0.077213 0.457627 0.180791 0.288136 0.182674 0.348399 0.069680 0.700565 0.032015 0.197740 0.043315 0.020716 0.890772 0.045198 0.156309 0.146893 0.111111 0.585687 0.184557 0.026365 0.726930 0.062147 0.246704 0.489642 0.045198 0.218456 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1378.1 MOTIF MA0955.1 POPTR_0002s00440g letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 1001 E= 0 0.200799 0.265734 0.324675 0.208791 0.009009 0.029029 0.954955 0.007007 0.008000 0.011000 0.099000 0.882000 0.951952 0.043043 0.005005 0.000000 0.153000 0.706000 0.029000 0.112000 0.041041 0.080080 0.859860 0.019019 0.187812 0.049950 0.695305 0.066933 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0955.1 MOTIF MA0784.1 POU1F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 2128 E= 0 0.569079 0.116071 0.128289 0.186560 0.462674 0.050451 0.076702 0.410172 0.106358 0.031985 0.041618 0.820039 0.970360 0.006384 0.014592 0.008664 0.019798 0.032556 0.011439 0.936208 0.011950 0.004695 0.908237 0.075117 0.033493 0.727273 0.056049 0.183185 0.590126 0.005589 0.003260 0.401025 0.922810 0.004770 0.035559 0.036860 0.993928 0.004671 0.000000 0.001401 0.033319 0.016221 0.017536 0.932924 0.085714 0.093050 0.324324 0.496911 0.768508 0.062839 0.070061 0.098592 0.189203 0.123136 0.547044 0.140617 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0784.1 MOTIF MA0785.1 POU2F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 10583 E= 0 0.479637 0.183124 0.141170 0.196069 0.388598 0.075962 0.155556 0.379884 0.057451 0.102363 0.036021 0.804164 0.992125 0.001125 0.002719 0.004032 0.013364 0.043759 0.018604 0.924273 0.015276 0.006735 0.869087 0.108903 0.019221 0.677986 0.086558 0.216235 0.650159 0.003095 0.004314 0.342431 0.856426 0.008741 0.071140 0.063694 0.977281 0.003417 0.004710 0.014592 0.107597 0.034579 0.057128 0.800696 0.186732 0.173880 0.236628 0.402759 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0785.1 MOTIF MA0507.1 POU2F2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2287 E= 0 0.181460 0.277656 0.175776 0.365107 0.231745 0.116310 0.259292 0.392654 0.264539 0.360735 0.181460 0.193266 0.881504 0.008308 0.000437 0.109751 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.111937 0.000875 0.000000 0.887188 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.069086 0.000000 0.873196 0.057718 0.000000 0.993004 0.000000 0.006996 0.986882 0.013118 0.000000 0.000000 0.000000 0.000875 0.000000 0.999125 0.506777 0.017053 0.268037 0.208133 0.259729 0.157849 0.046786 0.535636 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0507.1