MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1022.1 PHYPADRAFT_38837 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.251000 0.264000 0.257000 0.228000 0.343000 0.186000 0.254000 0.217000 0.463000 0.085000 0.129000 0.323000 0.827173 0.067932 0.023976 0.080919 0.855000 0.062000 0.001000 0.082000 0.644000 0.216000 0.054000 0.086000 0.061000 0.027000 0.860000 0.052000 0.150000 0.269000 0.207000 0.374000 0.259259 0.174174 0.307307 0.259259 0.283283 0.262262 0.227227 0.227227 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1022.1 MOTIF MA1021.1 PHYPADRAFT_48267 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.154000 0.461000 0.154000 0.231000 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.052947 0.000999 0.945055 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.143000 0.642000 0.072000 0.143000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1021.1 MOTIF MA1010.1 PHYPADRAFT_64121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1000 E= 0 0.264000 0.273000 0.180000 0.283000 0.041000 0.041000 0.041000 0.877000 0.020000 0.020000 0.853000 0.107000 0.107000 0.020000 0.125000 0.748000 0.019980 0.940060 0.019980 0.019980 0.000000 0.087087 0.912913 0.000000 0.087087 0.000000 0.912913 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.608000 0.070000 0.158000 0.164000 0.288000 0.209000 0.209000 0.294000 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1010.1 MOTIF MA1011.1 PHYPADRAFT_72483 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.264000 0.238000 0.308000 0.190000 0.210000 0.181000 0.272000 0.337000 0.069069 0.849850 0.017017 0.064064 0.806807 0.000000 0.106106 0.087087 0.054945 0.799201 0.000000 0.145854 0.145854 0.000000 0.799201 0.054945 0.087087 0.106106 0.000000 0.806807 0.064064 0.017017 0.849850 0.069069 0.337000 0.272000 0.181000 0.210000 0.190000 0.308000 0.238000 0.264000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1011.1 MOTIF MA0559.1 PI letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 558 E= 0 0.279570 0.600358 0.086022 0.034050 0.102151 0.706093 0.078853 0.112903 0.639785 0.141577 0.120072 0.098566 0.802867 0.021505 0.148746 0.026882 0.987455 0.001792 0.007168 0.003584 0.892473 0.000000 0.021505 0.086022 0.539427 0.014337 0.437276 0.008961 0.559140 0.025090 0.123656 0.292115 0.413978 0.000000 0.586022 0.000000 0.012545 0.010753 0.976703 0.000000 0.799283 0.096774 0.012545 0.091398 0.887097 0.012545 0.043011 0.057348 0.817204 0.046595 0.107527 0.028674 0.458781 0.103943 0.356631 0.080645 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0559.1 MOTIF MA0552.1 PIF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 114 E= 0 0.324561 0.105263 0.324561 0.245614 0.219298 0.000000 0.464912 0.315789 0.307018 0.245614 0.254386 0.192982 0.464912 0.070175 0.350877 0.114035 0.236842 0.236842 0.280702 0.245614 0.078947 0.149123 0.640351 0.131579 0.333333 0.122807 0.122807 0.421053 0.000000 0.903509 0.096491 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.991228 0.008772 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.017544 0.000000 0.982456 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.192982 0.201754 0.447368 0.157895 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0552.1 MOTIF MA0560.1 PIF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 527 E= 0 0.398482 0.049336 0.280835 0.271347 0.110057 0.248577 0.421252 0.220114 0.036053 0.757116 0.178368 0.028463 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.776091 0.000000 0.223909 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.491461 0.062619 0.259962 0.185958 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0560.1 MOTIF MA0561.1 PIF4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 335 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.146269 0.000000 0.853731 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.295522 0.546269 0.158209 0.191045 0.614925 0.194030 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0561.1 MOTIF MA0562.1 PIF5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 286 E= 0 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.318182 0.000000 0.681818 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.332168 0.562937 0.104895 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0562.1 MOTIF MA1364.1 PIF7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 112 E= 0 0.098214 0.294643 0.482143 0.125000 0.250000 0.178571 0.196429 0.375000 0.169643 0.080357 0.455357 0.294643 0.410714 0.071429 0.348214 0.169643 0.375000 0.125000 0.285714 0.214286 0.250000 0.071429 0.196429 0.482143 0.035714 0.258929 0.589286 0.116071 0.035714 0.758929 0.035714 0.169643 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.946429 0.000000 0.053571 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.982143 0.017857 0.044643 0.214286 0.580357 0.160714 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1364.1