MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0457.1 PHDP letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.235294 0.352941 0.000000 0.411765 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.058824 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058824 0.000000 0.058824 0.882353 0.470588 0.058824 0.235294 0.235294 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0457.1 MOTIF MA0356.1 PHO2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 101 E= 0 0.514851 0.000000 0.079208 0.405941 0.120000 0.000000 0.000000 0.880000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.560000 0.000000 0.000000 0.440000 0.230000 0.000000 0.000000 0.770000 0.630000 0.000000 0.000000 0.370000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0356.1 MOTIF MA0357.1 PHO4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.094188 0.393788 0.508016 0.004008 0.097194 0.901804 0.000000 0.001002 0.968938 0.001002 0.028056 0.002004 0.000000 0.913741 0.001003 0.085256 0.085256 0.001003 0.913741 0.000000 0.002004 0.028056 0.001002 0.968938 0.001002 0.000000 0.901804 0.097194 0.004008 0.508016 0.393788 0.094188 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0357.1 MOTIF MA0713.1 PHOX2A letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 15335 E= 0 0.141115 0.080861 0.032410 0.745615 0.805268 0.015846 0.108388 0.070498 0.996601 0.000000 0.002963 0.000436 0.076307 0.247857 0.035240 0.640596 0.044458 0.369025 0.160022 0.426494 0.093461 0.339184 0.059690 0.507665 0.789423 0.049503 0.130903 0.030171 0.946994 0.016482 0.025592 0.010933 0.000000 0.000874 0.000175 0.998952 0.084525 0.057939 0.006032 0.851504 0.808857 0.016200 0.057725 0.117218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0713.1 MOTIF MA0987.1 PHYPADRAFT_140773 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.243000 0.266000 0.253000 0.238000 0.302302 0.215215 0.260260 0.222222 0.395604 0.110889 0.172827 0.320679 0.887113 0.042957 0.009990 0.059940 0.892000 0.046000 0.001000 0.061000 0.715000 0.205000 0.028000 0.052000 0.072000 0.022000 0.839000 0.067000 0.182000 0.258000 0.229000 0.331000 0.271000 0.193000 0.271000 0.265000 0.280280 0.218218 0.272272 0.229229 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0987.1 MOTIF MA0988.1 PHYPADRAFT_143875 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.250000 0.272000 0.222000 0.256000 0.208000 0.231000 0.392000 0.169000 0.106000 0.844000 0.012000 0.038000 0.923924 0.000000 0.010010 0.066066 0.021978 0.939061 0.000000 0.038961 0.038961 0.000000 0.939061 0.021978 0.066066 0.010010 0.000000 0.923924 0.038000 0.012000 0.844000 0.106000 0.169000 0.392000 0.231000 0.208000 0.256000 0.222000 0.272000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0988.1 MOTIF MA0989.1 PHYPADRAFT_153324 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0 0.253000 0.264000 0.261000 0.222000 0.334000 0.193000 0.255000 0.218000 0.481518 0.070929 0.117882 0.329670 0.860140 0.061938 0.012987 0.064935 0.926000 0.036000 0.000000 0.038000 0.672000 0.147000 0.052000 0.129000 0.070929 0.026973 0.897103 0.004995 0.139000 0.288000 0.195000 0.378000 0.285000 0.158000 0.297000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0989.1 MOTIF MA1007.1 PHYPADRAFT_173530 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.071928 0.000999 0.285714 0.641359 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050050 0.000000 0.000000 0.949950 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.150150 0.000000 0.849850 0.084000 0.001000 0.665000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1007.1 MOTIF MA1008.1 PHYPADRAFT_182268 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.292000 0.180000 0.180000 0.348000 0.144000 0.079000 0.288000 0.489000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.076000 0.000000 0.924000 0.070070 0.070070 0.789790 0.070070 0.292000 0.246000 0.291000 0.171000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1008.1 MOTIF MA1023.1 PHYPADRAFT_28324 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.071928 0.071928 0.285714 0.570430 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.217217 0.000000 0.782783 0.117882 0.000999 0.704296 0.176823 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1023.1