MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0676.1 Nr2e1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1954 E= 0 0.572160 0.124872 0.097748 0.205220 0.552372 0.043972 0.221344 0.182312 0.902341 0.000807 0.081517 0.015335 0.934002 0.000000 0.061821 0.004177 0.034305 0.000000 0.958834 0.006861 0.000000 0.049320 0.000000 0.950680 0.008779 0.892259 0.009577 0.089385 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.693118 0.081215 0.072536 0.153131 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0676.1 MOTIF MA0164.1 Nr2e3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.173913 0.521739 0.086957 0.217391 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0164.1 MOTIF PB0049.1 Nr2f2_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.252525 0.181818 0.272727 0.292929 0.262626 0.383838 0.151515 0.202020 0.141414 0.242424 0.242424 0.373737 0.247525 0.336634 0.178218 0.237624 0.851485 0.039604 0.049505 0.059406 0.800000 0.010000 0.180000 0.010000 0.810000 0.000000 0.190000 0.000000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.979798 0.020202 0.000000 0.000000 0.020000 0.980000 0.000000 0.950495 0.009901 0.039604 0.930000 0.000000 0.070000 0.000000 0.306931 0.326733 0.079208 0.287129 0.240000 0.250000 0.380000 0.130000 0.280000 0.230000 0.230000 0.260000 0.212121 0.212121 0.363636 0.212121 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0049.1 MOTIF PB0153.1 Nr2f2_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.198020 0.435644 0.198020 0.168317 0.130000 0.130000 0.420000 0.320000 0.242424 0.444444 0.171717 0.141414 0.188119 0.188119 0.405941 0.217822 0.010000 0.540000 0.180000 0.270000 0.010000 0.590000 0.340000 0.060000 0.090909 0.000000 0.909091 0.000000 0.000000 0.000000 0.989899 0.010101 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010101 0.989899 0.000000 0.970000 0.010000 0.020000 0.949495 0.000000 0.050505 0.000000 0.220000 0.390000 0.250000 0.140000 0.150000 0.260000 0.330000 0.260000 0.180000 0.290000 0.230000 0.300000 0.356436 0.198020 0.138614 0.306931 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0153.1 MOTIF MA0677.1 Nr2f6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 438 E= 0 0.347032 0.155251 0.372146 0.125571 0.552430 0.028133 0.404092 0.015345 0.028571 0.020000 0.891429 0.060000 0.031609 0.022989 0.876437 0.068966 0.013825 0.041475 0.057604 0.887097 0.018092 0.860197 0.029605 0.092105 0.953782 0.012605 0.016807 0.016807 0.828460 0.021442 0.081871 0.068226 0.924025 0.004107 0.071869 0.000000 0.006079 0.006079 0.972644 0.015198 0.011940 0.002985 0.937313 0.047761 0.004484 0.022422 0.033632 0.939462 0.001439 0.883453 0.030216 0.084892 0.885602 0.013807 0.086785 0.013807 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0677.1 MOTIF MA0728.1 Nr2f6(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 288 E= 0 0.347222 0.055556 0.597222 0.000000 0.825545 0.000000 0.165109 0.009346 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.005435 0.000000 0.994565 0.000000 0.000000 0.000000 0.002639 0.997361 0.000000 0.927677 0.001391 0.070932 0.940952 0.057143 0.000000 0.001905 0.953052 0.009390 0.016432 0.021127 0.518868 0.000000 0.295597 0.185535 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.968750 0.031250 0.005391 0.000000 0.000000 0.994609 0.000000 0.995595 0.000000 0.004405 0.980220 0.000000 0.019780 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0728.1 MOTIF MA0505.1 Nr5a2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1702 E= 0 0.378966 0.131610 0.372503 0.116921 0.578731 0.099882 0.197415 0.123972 0.162162 0.116334 0.581669 0.139835 0.071680 0.222092 0.215041 0.491187 0.041716 0.206228 0.013514 0.738543 0.004700 0.949471 0.043478 0.002350 0.990012 0.008226 0.000000 0.001763 0.986486 0.000000 0.013514 0.000000 0.022914 0.000000 0.977086 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.099295 0.343126 0.035840 0.521739 0.000000 0.921269 0.007051 0.071680 0.844301 0.011751 0.052879 0.091069 0.159224 0.202703 0.434783 0.203290 0.146298 0.407168 0.266745 0.179788 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0505.1 MOTIF MF0004.1 Nuclear Receptor class letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0 0.488700 0.035000 0.371000 0.105300 0.031600 0.006900 0.866300 0.095200 0.055806 0.023602 0.800680 0.119912 0.145500 0.047400 0.067700 0.739400 0.131600 0.777200 0.040800 0.050400 0.743600 0.173900 0.066200 0.016300 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MF0004.1 MOTIF MA1417.1 O2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2038 E= 0 0.150147 0.183513 0.513248 0.153091 0.063297 0.191855 0.074092 0.670756 0.014230 0.004416 0.929833 0.051521 0.027478 0.961237 0.005888 0.005397 0.001472 0.989205 0.008342 0.000981 0.991658 0.001472 0.005888 0.000981 0.008832 0.728656 0.003435 0.259078 0.173700 0.050540 0.770854 0.004907 0.001963 0.006379 0.000981 0.990677 0.009323 0.976938 0.013739 0.000000 0.962218 0.005397 0.030422 0.001963 0.018155 0.138371 0.202159 0.641315 0.060844 0.820412 0.047596 0.071148 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1417.1 MOTIF MA0348.1 OAF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.110000 0.320000 0.110000 0.460000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.565657 0.000000 0.434343 0.000000 0.070000 0.000000 0.860000 0.070000 0.673267 0.039604 0.039604 0.247525 0.141414 0.070707 0.070707 0.717172 0.571429 0.142857 0.142857 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0348.1