MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0842.1 NRL letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5786 E= 0 0.389043 0.133426 0.212236 0.265296 0.439088 0.105063 0.151201 0.304648 0.344971 0.153992 0.102834 0.398203 0.241576 0.238120 0.213582 0.306722 0.090677 0.199953 0.036736 0.672634 0.008534 0.003926 0.987541 0.000000 0.136911 0.839159 0.000000 0.023930 0.068134 0.041275 0.012595 0.877997 0.051302 0.013023 0.761115 0.174559 0.868638 0.048191 0.022219 0.060952 0.047010 0.571206 0.158140 0.223643 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0842.1 MOTIF MA0421.1 NSI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1905 E= 0 0.091339 0.000000 0.143832 0.764829 0.000000 0.000000 0.021540 0.978460 0.000000 0.054584 0.000000 0.945416 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.063543 0.936457 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.026732 0.000000 0.973268 0.000000 0.384122 0.414694 0.057692 0.143491 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0421.1 MOTIF MA1046.1 NTL9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1001 E= 0 0.009990 0.009990 0.009990 0.970030 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.009990 0.009990 0.009990 0.970030 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1046.1 MOTIF MA1157.1 NUC letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 570 E= 0 0.243860 0.180702 0.152632 0.422807 0.247368 0.182456 0.157895 0.412281 0.264912 0.191228 0.145614 0.398246 0.298246 0.135088 0.147368 0.419298 0.222807 0.133333 0.149123 0.494737 0.122807 0.082456 0.073684 0.721053 0.014035 0.057895 0.033333 0.894737 0.000000 0.008772 0.014035 0.977193 0.000000 0.014035 0.000000 0.985965 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.008772 0.991228 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.031579 0.089474 0.668421 0.210526 0.005263 0.033333 0.057895 0.903509 0.110526 0.156140 0.080702 0.652632 0.129825 0.000000 0.005263 0.864912 0.259649 0.071930 0.026316 0.642105 0.098246 0.321053 0.354386 0.226316 0.042105 0.259649 0.096491 0.601754 0.229825 0.094737 0.398246 0.277193 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1157.1 MOTIF MA0623.1 Neurog1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.425425 0.113113 0.235235 0.226226 0.170000 0.592000 0.171000 0.067000 0.271000 0.688000 0.027000 0.014000 0.665000 0.035000 0.187000 0.113000 0.001001 0.064064 0.143143 0.791792 0.794000 0.141000 0.056000 0.009000 0.075924 0.150849 0.010989 0.762238 0.011988 0.000999 0.869131 0.117882 0.038961 0.150849 0.421578 0.388611 0.092000 0.270000 0.235000 0.403000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0623.1 MOTIF MA0150.2 Nfe2l2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 726 E= 0 0.228650 0.465565 0.150138 0.155647 0.552342 0.107438 0.219008 0.121212 0.162534 0.329201 0.378788 0.129477 0.279614 0.340220 0.209366 0.170799 0.672176 0.038567 0.282369 0.006887 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.979339 0.020661 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.027548 0.734160 0.162534 0.075758 0.115702 0.027548 0.022039 0.834711 0.089532 0.756198 0.063361 0.090909 0.794766 0.004132 0.123967 0.077135 0.013774 0.015152 0.961433 0.009642 0.005510 0.962810 0.026171 0.005510 0.858127 0.035813 0.042700 0.063361 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0150.2 MOTIF PH0109.1 Nkx1-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.350000 0.070000 0.120000 0.460000 0.168317 0.247525 0.544554 0.039604 0.260000 0.480000 0.130000 0.130000 0.353535 0.202020 0.404040 0.040404 0.050000 0.630000 0.130000 0.190000 0.009901 0.415842 0.000000 0.574257 0.888889 0.111111 0.000000 0.000000 0.959596 0.000000 0.000000 0.040404 0.040404 0.000000 0.000000 0.959596 0.000000 0.000000 0.111111 0.888889 0.574257 0.000000 0.415842 0.009901 0.190000 0.130000 0.630000 0.050000 0.010000 0.460000 0.060000 0.470000 0.110000 0.100000 0.680000 0.110000 0.101010 0.313131 0.494949 0.090909 0.160000 0.160000 0.490000 0.190000 0.360000 0.200000 0.260000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0109.1 MOTIF PH0110.1 Nkx1-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.257426 0.158416 0.297030 0.287129 0.188119 0.158416 0.227723 0.425743 0.120000 0.250000 0.350000 0.280000 0.198020 0.495050 0.178218 0.128713 0.475248 0.069307 0.396040 0.059406 0.110000 0.470000 0.070000 0.350000 0.020000 0.300000 0.000000 0.680000 0.939394 0.060606 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.040000 0.040000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.060606 0.939394 0.680000 0.000000 0.300000 0.020000 0.350000 0.070000 0.470000 0.110000 0.110000 0.150000 0.180000 0.560000 0.280000 0.150000 0.340000 0.230000 0.099010 0.564356 0.198020 0.138614 0.565657 0.050505 0.020202 0.363636 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0110.1 MOTIF PH0171.1 Nkx2-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.140000 0.320000 0.150000 0.390000 0.404040 0.232323 0.232323 0.131313 0.680000 0.040000 0.180000 0.100000 0.140000 0.200000 0.470000 0.190000 0.070000 0.830000 0.090000 0.010000 0.000000 0.880000 0.000000 0.120000 0.900000 0.020000 0.000000 0.080000 0.020000 0.980000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.160000 0.000000 0.830000 0.190000 0.120000 0.670000 0.020000 0.888889 0.000000 0.010101 0.101010 0.454545 0.333333 0.181818 0.030303 0.340000 0.320000 0.070000 0.270000 0.210000 0.120000 0.050000 0.620000 0.170000 0.150000 0.050000 0.630000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0171.1 MOTIF PH0111.1 Nkx2-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.260000 0.140000 0.300000 0.270000 0.140000 0.150000 0.440000 0.484848 0.212121 0.232323 0.070707 0.434343 0.070707 0.333333 0.161616 0.121212 0.707071 0.171717 0.000000 0.000000 0.880000 0.000000 0.120000 0.920000 0.010000 0.000000 0.070000 0.020202 0.979798 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.200000 0.000000 0.800000 0.131313 0.101010 0.757576 0.010101 0.930000 0.000000 0.010000 0.060000 0.500000 0.110000 0.360000 0.030000 0.670000 0.070000 0.110000 0.150000 0.356436 0.099010 0.227723 0.316832 0.130000 0.190000 0.200000 0.480000 0.290000 0.160000 0.230000 0.320000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0111.1