MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1111.1 NR2F2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2204 E= 0 0.221416 0.313975 0.189655 0.274955 0.465971 0.206897 0.145191 0.181942 0.811252 0.016788 0.078494 0.093466 0.945554 0.006806 0.037205 0.010436 0.016788 0.007260 0.956443 0.019510 0.014973 0.005445 0.967332 0.012250 0.007713 0.009982 0.013612 0.968693 0.013612 0.897459 0.011797 0.077132 0.957804 0.007260 0.019510 0.015426 0.287205 0.228221 0.246824 0.237750 0.384301 0.174229 0.259528 0.181942 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1111.1 MOTIF MA0113.1 NR3C1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 9 E= 0 0.333333 0.222222 0.444444 0.000000 0.444444 0.000000 0.555556 0.000000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.777778 0.000000 0.111111 0.111111 0.666667 0.111111 0.111111 0.111111 0.111111 0.666667 0.222222 0.000000 0.888889 0.000000 0.111111 0.000000 0.222222 0.000000 0.222222 0.555556 0.333333 0.222222 0.000000 0.444444 0.555556 0.333333 0.000000 0.111111 0.111111 0.333333 0.000000 0.555556 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.222222 0.444444 0.000000 0.333333 0.000000 0.888889 0.111111 0.000000 0.111111 0.222222 0.111111 0.555556 0.444444 0.000000 0.444444 0.111111 0.333333 0.111111 0.222222 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0113.1 MOTIF MA0113.2 NR3C1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 465 E= 0 0.533333 0.000000 0.322581 0.144086 0.150538 0.000000 0.795699 0.053763 0.445161 0.202151 0.234409 0.118280 0.862366 0.000000 0.077419 0.060215 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.827957 0.000000 0.030108 0.141935 0.326882 0.292473 0.380645 0.000000 0.503226 0.152688 0.174194 0.169892 0.535484 0.230108 0.234409 0.000000 0.232258 0.000000 0.040860 0.726882 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.101075 0.017204 0.000000 0.881720 0.258065 0.348387 0.000000 0.393548 0.000000 0.875269 0.000000 0.124731 0.129032 0.322581 0.000000 0.548387 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0113.2 MOTIF MA0113.3 NR3C1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 22824 E= 0 0.285664 0.099632 0.401726 0.212978 0.404139 0.004867 0.580760 0.010234 0.001459 0.000255 0.996900 0.001386 0.391188 0.026234 0.124995 0.457583 0.998519 0.000439 0.000494 0.000548 0.000000 0.999428 0.000572 0.000000 0.959027 0.000937 0.036339 0.003696 0.101508 0.393252 0.065056 0.440184 0.337037 0.159282 0.243498 0.260184 0.517362 0.043699 0.356346 0.082593 0.003313 0.023111 0.002045 0.971530 0.000000 0.000405 0.999411 0.000184 0.000327 0.000367 0.002041 0.997265 0.383933 0.136889 0.028169 0.451009 0.001348 0.996078 0.000204 0.002370 0.009395 0.588767 0.007548 0.394291 0.266830 0.382374 0.133050 0.217746 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0113.3 MOTIF MA0727.1 NR3C2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 48045 E= 0 0.174961 0.139203 0.420293 0.265543 0.351855 0.005290 0.630334 0.012522 0.001020 0.000143 0.997762 0.001074 0.446970 0.035124 0.169626 0.348281 0.998770 0.000499 0.000432 0.000299 0.000000 0.999900 0.000100 0.000000 0.962604 0.000804 0.030244 0.006347 0.162354 0.403796 0.069476 0.364374 0.424144 0.113908 0.201230 0.260718 0.534291 0.045060 0.326868 0.093781 0.008934 0.022191 0.000490 0.968385 0.000000 0.000153 0.999847 0.000000 0.000090 0.000516 0.000067 0.999326 0.335924 0.179448 0.032791 0.451837 0.000374 0.997476 0.000210 0.001939 0.012925 0.592716 0.013433 0.380926 0.210842 0.404234 0.180635 0.204289 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0727.1 MOTIF MA1112.1 NR4A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8381 E= 0 0.293998 0.207851 0.213459 0.284692 0.677843 0.052500 0.148550 0.121107 0.979000 0.001432 0.008591 0.010977 0.972080 0.019449 0.001790 0.006682 0.002625 0.022551 0.955614 0.019210 0.004057 0.002028 0.992006 0.001909 0.002028 0.003341 0.002506 0.992125 0.005369 0.992602 0.000000 0.002028 0.763274 0.049875 0.102732 0.084119 0.240902 0.278606 0.240067 0.240425 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1112.1 MOTIF MA0160.1 NR4A2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 13 E= 0 0.615385 0.076923 0.230769 0.076923 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.000000 0.000000 0.928571 0.071429 0.214286 0.000000 0.785714 0.000000 0.142857 0.142857 0.000000 0.714286 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.615385 0.153846 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0160.1 MOTIF MA1147.1 NR4A2::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1001 E= 0 0.287712 0.211788 0.370629 0.129870 0.498498 0.124124 0.348348 0.029029 0.019980 0.010989 0.923077 0.045954 0.050949 0.006993 0.803197 0.138861 0.046046 0.134134 0.128128 0.691692 0.007000 0.824000 0.031000 0.138000 0.592000 0.038000 0.343000 0.027000 0.248248 0.060060 0.087087 0.604605 0.002000 0.069000 0.005000 0.924000 0.070000 0.082000 0.836000 0.012000 0.926000 0.054000 0.017000 0.003000 0.157000 0.830000 0.002000 0.011000 0.039960 0.936064 0.003996 0.019980 0.005000 0.535000 0.023000 0.437000 0.103896 0.472527 0.179820 0.243756 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1147.1 MOTIF MA0506.1 NRF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4624 E= 0 0.130190 0.081099 0.788711 0.000000 0.134732 0.865268 0.000000 0.000000 0.042388 0.040874 0.916739 0.000000 0.000000 0.868512 0.101211 0.030277 0.327422 0.402682 0.202206 0.067690 0.000000 0.087154 0.114187 0.798659 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.938149 0.000000 0.061851 0.000000 0.075476 0.924524 0.000000 0.016003 0.983997 0.000000 0.000000 0.485510 0.173875 0.340614 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0506.1 MOTIF MA0347.1 NRG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.181181 0.404404 0.143143 0.271271 0.243243 0.225225 0.199199 0.332332 0.293587 0.250501 0.278557 0.177355 0.259519 0.239479 0.262525 0.238477 0.419840 0.112224 0.269539 0.198397 0.213213 0.255255 0.092092 0.439439 0.455912 0.488978 0.009018 0.046092 0.960961 0.003003 0.036036 0.000000 0.002004 0.001002 0.992986 0.004008 0.002004 0.001002 0.994990 0.002004 0.011022 0.000000 0.987976 0.001002 0.071071 0.011011 0.002002 0.915916 0.004012 0.930792 0.002006 0.063190 0.003003 0.820821 0.003003 0.173173 0.504008 0.087174 0.039078 0.369739 0.245737 0.202608 0.239719 0.311936 0.124248 0.303607 0.269539 0.302605 0.224449 0.067134 0.549098 0.159319 0.206620 0.401204 0.228686 0.163490 0.325651 0.171343 0.233467 0.269539 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0347.1