MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1163.1 AT5G45580 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 597 E= 0 0.519263 0.127303 0.184255 0.169179 0.534338 0.053601 0.177554 0.234506 0.469012 0.077052 0.214405 0.239531 0.433836 0.137353 0.428811 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.914573 0.073702 0.000000 0.011725 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.668342 0.331658 0.000000 0.000000 0.048576 0.000000 0.000000 0.951424 0.139028 0.011725 0.020101 0.829146 0.103853 0.589615 0.038526 0.268007 0.127303 0.301508 0.162479 0.408710 0.251256 0.174204 0.247906 0.326633 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1163.1 MOTIF MA1365.1 AT5G47660 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 244 E= 0 0.303279 0.073770 0.053279 0.569672 0.311475 0.122951 0.135246 0.430328 0.262295 0.299180 0.057377 0.381148 0.266393 0.258197 0.102459 0.372951 0.278689 0.086066 0.188525 0.446721 0.081967 0.032787 0.102459 0.782787 0.180328 0.004098 0.000000 0.815574 0.024590 0.061475 0.040984 0.872951 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.290984 0.032787 0.000000 0.676230 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.049180 0.581967 0.040984 0.327869 0.094262 0.098361 0.692623 0.114754 0.049180 0.340164 0.024590 0.586066 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1365.1 MOTIF MA1195.1 AT5G56840 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.558333 0.075000 0.095000 0.271667 0.628333 0.033333 0.120000 0.218333 0.078333 0.540000 0.061667 0.320000 0.190000 0.596667 0.098333 0.115000 0.018333 0.040000 0.003333 0.938333 0.021667 0.031667 0.011667 0.935000 0.990000 0.005000 0.000000 0.005000 0.000000 0.003333 0.001667 0.995000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.801667 0.000000 0.188333 0.720000 0.010000 0.078333 0.191667 0.373333 0.143333 0.050000 0.433333 0.555000 0.006667 0.016667 0.421667 0.423333 0.113333 0.041667 0.421667 0.328333 0.245000 0.146667 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1195.1 MOTIF MA1189.1 AT5G61620 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.342237 0.136895 0.248748 0.272120 0.429048 0.030050 0.113523 0.427379 0.347245 0.016694 0.016694 0.619366 0.292154 0.050083 0.186978 0.470785 0.190317 0.096828 0.010017 0.702838 0.160267 0.000000 0.839733 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.933222 0.026711 0.015025 0.025042 0.854758 0.000000 0.088481 0.056761 0.252087 0.078464 0.517529 0.151920 0.440735 0.091820 0.318865 0.148581 0.308848 0.118531 0.058431 0.514190 0.298831 0.086811 0.103506 0.510851 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1189.1 MOTIF MA1267.1 AT5G66940 letter-probability matrix: alength= 4 w= 29 nsites= 597 E= 0 0.252931 0.194305 0.120603 0.432161 0.231156 0.229481 0.103853 0.435511 0.221106 0.159129 0.155779 0.463987 0.152429 0.221106 0.082077 0.544389 0.175879 0.237856 0.070352 0.515913 0.140704 0.174204 0.068677 0.616415 0.170854 0.190955 0.055276 0.582915 0.244556 0.199330 0.061977 0.494137 0.224456 0.249581 0.103853 0.422111 0.179229 0.308208 0.053601 0.458961 0.107203 0.232831 0.043551 0.616415 0.149079 0.065327 0.053601 0.731993 0.120603 0.073702 0.058626 0.747069 0.033501 0.194305 0.041876 0.730318 0.189280 0.175879 0.045226 0.589615 0.485762 0.132328 0.179229 0.202680 0.001675 0.979899 0.016750 0.001675 0.001675 0.035176 0.001675 0.961474 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001675 0.000000 0.998325 0.175879 0.036851 0.001675 0.785595 0.095477 0.130653 0.144054 0.629816 0.204355 0.231156 0.201005 0.363484 0.236181 0.237856 0.172529 0.353434 0.222781 0.180905 0.102178 0.494137 0.207705 0.199330 0.115578 0.477387 0.180905 0.179229 0.135678 0.504188 0.246231 0.174204 0.090452 0.489112 0.304858 0.137353 0.083752 0.474037 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1267.1 MOTIF MA1261.1 AT5G67000 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 138 E= 0 0.246377 0.340580 0.108696 0.304348 0.188406 0.144928 0.304348 0.362319 0.282609 0.050725 0.413043 0.253623 0.289855 0.217391 0.101449 0.391304 0.072464 0.253623 0.115942 0.557971 0.398551 0.000000 0.579710 0.021739 0.000000 0.869565 0.000000 0.130435 0.000000 0.000000 0.985507 0.014493 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.768116 0.000000 0.231884 0.000000 0.021739 0.644928 0.333333 0.181159 0.000000 0.768116 0.050725 0.297101 0.384058 0.065217 0.253623 0.000000 0.072464 0.659420 0.268116 0.181159 0.188406 0.485507 0.144928 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1261.1 MOTIF PF0099.1 ATCMNTCCGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 344 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.215116 0.784884 0.000000 0.000000 0.090116 0.604651 0.090116 0.215116 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.988372 0.000000 0.011628 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0099.1 MOTIF MA0833.1 ATF4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 893 E= 0 0.235162 0.079507 0.494961 0.190370 0.186123 0.128855 0.450441 0.234581 0.658084 0.208033 0.130793 0.003090 0.000000 0.000000 0.007085 0.992915 0.016964 0.000000 0.973214 0.009821 0.972618 0.000000 0.000000 0.027382 0.002345 0.436108 0.010551 0.550996 0.000902 0.000000 0.995491 0.003607 0.039722 0.832175 0.015889 0.112214 0.973941 0.022801 0.000000 0.003257 0.991071 0.003348 0.001116 0.004464 0.000000 0.255278 0.059501 0.685221 0.478613 0.314451 0.116763 0.090173 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0833.1 MOTIF MA0834.1 ATF7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 19330 E= 0 0.202897 0.341749 0.215261 0.240093 0.265391 0.126229 0.377600 0.230781 0.822161 0.015653 0.160442 0.001744 0.000567 0.000206 0.002218 0.997008 0.001231 0.000331 0.915156 0.083282 0.995981 0.000412 0.002989 0.000618 0.001028 0.993779 0.001697 0.003496 0.004068 0.000463 0.995263 0.000206 0.001286 0.000823 0.003959 0.993932 0.122081 0.874615 0.002308 0.000995 0.996803 0.000103 0.002527 0.000567 0.003020 0.269001 0.016203 0.711776 0.291169 0.419887 0.110145 0.178799 0.293829 0.254513 0.304795 0.146863 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0834.1 MOTIF PF0102.1 ATGGYGGA letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 476 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.842437 0.000000 0.157563 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0102.1