MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0025.1 NFIL3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 23 E= 0 0.043478 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.086957 0.913043 0.956522 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.347826 0.000000 0.652174 0.086957 0.000000 0.913043 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.000000 0.478261 0.173913 0.347826 0.304348 0.217391 0.304348 0.173913 0.217391 0.217391 0.130435 0.434783 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0025.1 MOTIF MA0671.1 NFIX letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 32864 E= 0 0.241936 0.268074 0.265488 0.224501 0.238315 0.186648 0.330301 0.244736 0.188773 0.162262 0.098931 0.550034 0.003695 0.005207 0.920019 0.071079 0.000083 0.909026 0.090089 0.000802 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.928781 0.063023 0.005087 0.003109 0.666518 0.027501 0.257327 0.048654 0.251065 0.275043 0.277964 0.195929 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0671.1 MOTIF MA0105.1 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 38 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.026316 0.000000 0.973684 0.000000 0.657895 0.000000 0.342105 0.000000 0.500000 0.342105 0.026316 0.131579 0.184211 0.026316 0.078947 0.710526 0.026316 0.052632 0.052632 0.868421 0.052632 0.447368 0.000000 0.500000 0.052632 0.921053 0.000000 0.026316 0.000000 0.947368 0.000000 0.052632 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.1 MOTIF MA0105.2 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.611111 0.055556 0.333333 0.000000 0.277778 0.000000 0.111111 0.611111 0.000000 0.277778 0.111111 0.611111 0.000000 0.722222 0.000000 0.277778 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.2 MOTIF MA0105.3 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5112 E= 0 0.111502 0.062402 0.524648 0.301448 0.010759 0.000000 0.989241 0.000000 0.023670 0.000000 0.958920 0.017410 0.614437 0.043818 0.319836 0.021909 0.435837 0.235524 0.158842 0.169797 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010759 0.016432 0.972809 0.000000 0.298513 0.000000 0.701487 0.000000 0.950313 0.000000 0.049687 0.000000 0.983177 0.000000 0.016823 0.309077 0.468505 0.052621 0.169797 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.3 MOTIF MA0105.4 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 12262 E= 0 0.688387 0.164166 0.080737 0.066710 0.000472 0.000000 0.999266 0.000262 0.000000 0.000156 0.999739 0.000104 0.000205 0.000000 0.983478 0.016317 0.011614 0.000152 0.986864 0.001369 0.929534 0.004801 0.063574 0.002091 0.507574 0.001305 0.002319 0.488802 0.001391 0.082865 0.007332 0.908413 0.001748 0.984473 0.000411 0.013368 0.049517 0.950085 0.000100 0.000299 0.000417 0.999271 0.000104 0.000208 0.000621 0.998343 0.000207 0.000828 0.080679 0.084742 0.219426 0.615153 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.4 MOTIF MA0778.1 NFKB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 11783 E= 0 0.427820 0.208436 0.195706 0.168039 0.006124 0.005881 0.987752 0.000243 0.000062 0.000062 0.999688 0.000187 0.000481 0.000301 0.965250 0.033969 0.158606 0.000655 0.781954 0.058785 0.772421 0.090054 0.078901 0.058623 0.460091 0.005327 0.004528 0.530054 0.080227 0.095411 0.073661 0.750701 0.061968 0.800858 0.001382 0.135792 0.019732 0.976800 0.000077 0.003391 0.000157 0.999607 0.000079 0.000157 0.000619 0.997369 0.000232 0.001780 0.117299 0.255339 0.167614 0.459748 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0778.1 MOTIF MA0060.1 NFYA letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 116 E= 0 0.293103 0.318966 0.232759 0.155172 0.137931 0.284483 0.224138 0.353448 0.060345 0.439655 0.215517 0.284483 0.500000 0.120690 0.353448 0.025862 0.439655 0.034483 0.482759 0.043103 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.017241 0.974138 0.008621 0.000000 0.965517 0.000000 0.008621 0.025862 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.008621 0.000000 0.991379 0.120690 0.560345 0.284483 0.034483 0.568966 0.051724 0.362069 0.017241 0.112069 0.172414 0.629310 0.086207 0.336207 0.370690 0.189655 0.103448 0.310345 0.077586 0.405172 0.206897 0.215517 0.301724 0.250000 0.232759 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0060.1 MOTIF MA0060.2 NFYA letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 8768 E= 0 0.536953 0.172787 0.112112 0.178148 0.135379 0.112568 0.522354 0.229699 0.404653 0.257299 0.247263 0.090785 0.137203 0.339074 0.453695 0.070027 0.208257 0.267336 0.035698 0.488709 0.021898 0.095119 0.546077 0.336907 0.027030 0.842153 0.054859 0.075958 0.001825 0.113253 0.027600 0.857322 0.025319 0.116104 0.819001 0.039576 0.975707 0.000228 0.017108 0.006957 0.000570 0.005931 0.000912 0.992587 0.001141 0.000570 0.000570 0.997719 0.003307 0.001141 0.994526 0.001026 0.001369 0.007984 0.990306 0.000342 0.042997 0.305315 0.001711 0.649977 0.052464 0.449703 0.213618 0.284215 0.175297 0.476277 0.253992 0.094434 0.485972 0.129562 0.308736 0.075730 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0060.2 MOTIF MA0060.3 NFYA letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4825 E= 0 0.393161 0.156891 0.376166 0.073782 0.398756 0.083731 0.385078 0.132435 0.004767 0.965181 0.007047 0.023005 0.006425 0.976788 0.005803 0.010984 0.970570 0.006010 0.003523 0.019896 0.950052 0.019482 0.025699 0.004767 0.007668 0.027358 0.002280 0.962694 0.034404 0.873575 0.066114 0.025907 0.847254 0.044145 0.101347 0.007254 0.126632 0.234404 0.562280 0.076684 0.384456 0.283731 0.183834 0.147979 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0060.3