MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0498.1 Meis1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2607 E= 0 0.514384 0.046797 0.191408 0.247411 0.065593 0.291139 0.542386 0.100882 0.046414 0.924818 0.001151 0.027618 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.032605 0.019179 0.000000 0.948216 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.942846 0.000000 0.000000 0.057154 0.100115 0.427695 0.412351 0.059839 0.128117 0.205984 0.100882 0.565017 0.067127 0.564634 0.189490 0.178750 0.406214 0.209820 0.055619 0.328347 0.197545 0.307633 0.266974 0.227848 0.181051 0.386268 0.205600 0.227081 0.202915 0.282317 0.184120 0.330648 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0498.1 MOTIF PH0104.1 Meis2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.150000 0.100000 0.370000 0.504950 0.089109 0.178218 0.227723 0.280000 0.230000 0.280000 0.210000 0.070000 0.340000 0.360000 0.230000 0.920000 0.010000 0.040000 0.030000 0.019802 0.544554 0.415842 0.019802 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.000000 0.020000 0.000000 0.980000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.720000 0.040000 0.020000 0.220000 0.333333 0.080808 0.101010 0.484848 0.470000 0.200000 0.150000 0.180000 0.210000 0.330000 0.210000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0104.1 MOTIF PH0105.1 Meis3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.450000 0.130000 0.140000 0.280000 0.590000 0.060000 0.180000 0.170000 0.262626 0.212121 0.252525 0.272727 0.110000 0.280000 0.300000 0.310000 0.770000 0.020000 0.150000 0.060000 0.030000 0.510000 0.420000 0.040000 0.050000 0.870000 0.020000 0.060000 0.000000 0.030000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.030000 0.010000 0.000000 0.960000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.646465 0.060606 0.030303 0.262626 0.320000 0.130000 0.120000 0.430000 0.430000 0.270000 0.160000 0.140000 0.247525 0.425743 0.148515 0.178218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0105.1 MOTIF PH0103.1 Meox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.200000 0.430000 0.070000 0.386139 0.287129 0.267327 0.059406 0.181818 0.121212 0.444444 0.252525 0.180000 0.090000 0.530000 0.200000 0.010000 0.170000 0.000000 0.820000 0.910000 0.060000 0.030000 0.000000 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.030000 0.060000 0.910000 0.820000 0.000000 0.170000 0.010000 0.100000 0.430000 0.280000 0.190000 0.252525 0.444444 0.121212 0.181818 0.160000 0.290000 0.080000 0.470000 0.160000 0.400000 0.200000 0.240000 0.750000 0.080000 0.080000 0.090000 0.180000 0.090000 0.570000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0103.1 MOTIF MA0620.1 Mitf letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.274274 0.193193 0.312312 0.220220 0.398000 0.081000 0.462000 0.059000 0.077000 0.095000 0.100000 0.728000 0.006993 0.988012 0.002997 0.001998 0.882000 0.052000 0.016000 0.050000 0.008000 0.725000 0.073000 0.194000 0.156000 0.033000 0.798000 0.013000 0.238238 0.191191 0.109109 0.461461 0.028000 0.028000 0.884000 0.060000 0.245000 0.215000 0.341000 0.199000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0620.1 MOTIF MA0622.1 Mlxip letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.053000 0.263000 0.421000 0.263000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.188000 0.063000 0.250000 0.499000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0622.1 MOTIF PH0039.1 Mnx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.120000 0.240000 0.370000 0.270000 0.140000 0.210000 0.300000 0.350000 0.560000 0.250000 0.170000 0.020000 0.110000 0.390000 0.380000 0.120000 0.010000 0.080000 0.000000 0.910000 0.979798 0.020202 0.000000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.000000 0.020202 0.979798 0.910000 0.000000 0.080000 0.010000 0.080000 0.160000 0.680000 0.080000 0.020000 0.170000 0.250000 0.560000 0.170000 0.090000 0.590000 0.150000 0.230000 0.270000 0.330000 0.170000 0.250000 0.350000 0.110000 0.290000 0.290000 0.300000 0.340000 0.070000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0039.1 MOTIF PH0106.1 Msx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.178218 0.237624 0.267327 0.316832 0.250000 0.190000 0.390000 0.170000 0.290000 0.430000 0.110000 0.170000 0.360000 0.200000 0.110000 0.330000 0.660000 0.060000 0.160000 0.120000 0.138614 0.425743 0.128713 0.306931 0.010000 0.240000 0.000000 0.750000 0.980000 0.020000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.820000 0.000000 0.170000 0.010000 0.440000 0.170000 0.210000 0.180000 0.099010 0.108911 0.178218 0.613861 0.260000 0.230000 0.180000 0.330000 0.310000 0.360000 0.130000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0106.1 MOTIF PH0107.1 Msx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.277228 0.257426 0.306931 0.158416 0.380000 0.280000 0.180000 0.160000 0.440000 0.120000 0.240000 0.200000 0.140000 0.230000 0.540000 0.090000 0.700000 0.080000 0.130000 0.090000 0.020000 0.800000 0.110000 0.070000 0.010000 0.560000 0.000000 0.430000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.950495 0.000000 0.039604 0.009901 0.150000 0.050000 0.560000 0.240000 0.110000 0.420000 0.080000 0.390000 0.160000 0.100000 0.470000 0.270000 0.250000 0.360000 0.110000 0.280000 0.090909 0.212121 0.111111 0.585859 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0107.1 MOTIF PH0108.1 Msx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.350000 0.230000 0.100000 0.606061 0.131313 0.161616 0.101010 0.400000 0.290000 0.100000 0.210000 0.757576 0.050505 0.131313 0.060606 0.770000 0.090000 0.090000 0.050000 0.040000 0.670000 0.190000 0.100000 0.000000 0.525253 0.000000 0.474747 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.700000 0.030000 0.150000 0.120000 0.181818 0.181818 0.303030 0.333333 0.222222 0.222222 0.181818 0.373737 0.310000 0.210000 0.100000 0.380000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0108.1