MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0040.1 Lef1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.210000 0.280000 0.230000 0.330000 0.150000 0.300000 0.220000 0.290000 0.150000 0.240000 0.320000 0.070707 0.404040 0.141414 0.383838 0.070000 0.620000 0.140000 0.170000 0.009901 0.900990 0.039604 0.049505 0.019802 0.019802 0.000000 0.960396 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.009901 0.029703 0.940594 0.019802 0.970000 0.000000 0.000000 0.030000 0.080000 0.000000 0.000000 0.920000 0.029703 0.673267 0.277228 0.019802 0.200000 0.120000 0.060000 0.620000 0.346535 0.168317 0.217822 0.267327 0.280000 0.150000 0.170000 0.400000 0.250000 0.340000 0.220000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0040.1 MOTIF PB0144.1 Lef1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.270000 0.390000 0.110000 0.440000 0.080000 0.230000 0.250000 0.420000 0.140000 0.320000 0.120000 0.170000 0.340000 0.390000 0.100000 0.810000 0.020000 0.010000 0.160000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.020000 0.900000 0.040000 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.930000 0.010000 0.040000 0.020000 0.029703 0.019802 0.049505 0.900990 0.110000 0.710000 0.010000 0.170000 0.673267 0.019802 0.277228 0.029703 0.237624 0.346535 0.188119 0.227723 0.090909 0.242424 0.202020 0.464646 0.330000 0.180000 0.110000 0.380000 0.336634 0.158416 0.188119 0.316832 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0144.1 MOTIF PH0091.1 Lhx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.370000 0.220000 0.090000 0.230000 0.180000 0.490000 0.100000 0.383838 0.171717 0.191919 0.252525 0.585859 0.090909 0.161616 0.161616 0.030000 0.170000 0.020000 0.780000 0.010000 0.080000 0.000000 0.910000 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.000000 0.020000 0.020000 0.000000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.910000 0.000000 0.080000 0.010000 0.780000 0.020000 0.170000 0.030000 0.370000 0.150000 0.080000 0.400000 0.500000 0.120000 0.090000 0.290000 0.640000 0.110000 0.060000 0.190000 0.277228 0.287129 0.138614 0.297030 0.150000 0.180000 0.350000 0.320000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0091.1 MOTIF PH0092.1 Lhx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.070000 0.120000 0.500000 0.440000 0.240000 0.210000 0.110000 0.450000 0.240000 0.120000 0.190000 0.666667 0.131313 0.141414 0.060606 0.050000 0.670000 0.010000 0.270000 0.010000 0.180000 0.000000 0.810000 0.939394 0.060606 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.040000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.060606 0.939394 0.810000 0.000000 0.180000 0.010000 0.270000 0.010000 0.670000 0.050000 0.110000 0.350000 0.150000 0.390000 0.140000 0.110000 0.390000 0.360000 0.380000 0.280000 0.170000 0.170000 0.270000 0.260000 0.220000 0.250000 0.230000 0.280000 0.260000 0.230000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0092.1 MOTIF MA0135.1 Lhx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 20 E= 0 0.450000 0.000000 0.150000 0.400000 0.800000 0.100000 0.100000 0.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.100000 0.000000 0.800000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.800000 0.050000 0.000000 0.150000 0.450000 0.000000 0.150000 0.400000 0.100000 0.400000 0.000000 0.500000 0.100000 0.450000 0.150000 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0135.1 MOTIF PH0093.1 Lhx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.290000 0.370000 0.110000 0.260000 0.230000 0.250000 0.260000 0.554455 0.227723 0.039604 0.178218 0.630000 0.090000 0.200000 0.080000 0.020000 0.100000 0.010000 0.870000 0.020000 0.030000 0.000000 0.950000 0.979798 0.000000 0.020202 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.000000 0.020202 0.000000 0.979798 0.950000 0.000000 0.030000 0.020000 0.870000 0.010000 0.100000 0.020000 0.425743 0.089109 0.128713 0.356436 0.343434 0.030303 0.080808 0.545455 0.410000 0.280000 0.080000 0.230000 0.336634 0.316832 0.108911 0.237624 0.111111 0.232323 0.313131 0.343434 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0093.1 MOTIF PH0094.1 Lhx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.100000 0.290000 0.370000 0.530000 0.240000 0.050000 0.180000 0.410000 0.170000 0.180000 0.240000 0.390000 0.220000 0.230000 0.160000 0.080000 0.710000 0.130000 0.080000 0.010000 0.200000 0.000000 0.790000 0.920000 0.010000 0.070000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.070000 0.010000 0.920000 0.790000 0.000000 0.200000 0.010000 0.080000 0.130000 0.710000 0.080000 0.090000 0.420000 0.270000 0.220000 0.089109 0.108911 0.247525 0.554455 0.310000 0.090000 0.140000 0.460000 0.060000 0.080000 0.190000 0.670000 0.180000 0.120000 0.550000 0.150000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0094.1 MOTIF MA0704.1 Lhx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 2895 E= 0 0.145769 0.282211 0.170984 0.401036 0.053913 0.226584 0.000000 0.719503 0.744856 0.110082 0.079475 0.065586 0.949197 0.000000 0.000000 0.050803 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.131215 0.016770 0.852015 0.855286 0.011518 0.093325 0.039870 0.453886 0.155095 0.296028 0.094991 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0704.1 MOTIF PH0095.1 Lhx5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.350000 0.300000 0.160000 0.252525 0.202020 0.313131 0.232323 0.465347 0.198020 0.138614 0.198020 0.620000 0.060000 0.200000 0.120000 0.030000 0.100000 0.020000 0.850000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.850000 0.020000 0.100000 0.030000 0.530000 0.140000 0.070000 0.260000 0.297030 0.118812 0.059406 0.524752 0.396040 0.237624 0.158416 0.207921 0.306931 0.316832 0.148515 0.227723 0.089109 0.287129 0.207921 0.415842 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0095.1 MOTIF PH0096.1 Lhx6_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.310000 0.380000 0.150000 0.400000 0.120000 0.150000 0.330000 0.282828 0.191919 0.343434 0.181818 0.237624 0.554455 0.089109 0.118812 0.306931 0.108911 0.524752 0.059406 0.059406 0.455446 0.019802 0.465347 0.009901 0.118812 0.000000 0.871287 0.830000 0.010000 0.160000 0.000000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.160000 0.010000 0.830000 0.871287 0.000000 0.118812 0.009901 0.465347 0.019802 0.455446 0.059406 0.108911 0.128713 0.267327 0.495050 0.220000 0.110000 0.410000 0.260000 0.060000 0.280000 0.220000 0.440000 0.525253 0.101010 0.060606 0.313131 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0096.1