MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1253.1 AT3G16280
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 561 E= 0
 0.290553  0.190731  0.165775  0.352941
 0.360071  0.114082  0.203209  0.322638
 0.206774  0.139037  0.303030  0.351159
 0.067736  0.098039  0.058824  0.775401
 0.044563  0.057041  0.853832  0.044563
 0.000000  0.000000  0.008913  0.991087
 0.000000  0.996435  0.000000  0.003565
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.010695  0.000000  0.989305  0.000000
 0.048128  0.098039  0.028520  0.825312
 0.089127  0.035651  0.791444  0.083779
 0.251337  0.144385  0.477718  0.126560
 0.304813  0.294118  0.121212  0.279857
 0.292335  0.128342  0.333333  0.245989
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1253.1

MOTIF MA1388.1 AT3G24120
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 600 E= 0
 0.423333  0.241667  0.335000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.953333  0.036667  0.000000  0.010000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.395000  0.605000  0.000000  0.000000
 0.206667  0.011667  0.016667  0.765000
 0.290000  0.090000  0.340000  0.280000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1388.1

MOTIF MA1368.1 AT3G25990
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 78 E= 0
 0.961538  0.000000  0.038462  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.782051  0.000000  0.217949
 0.794872  0.000000  0.205128  0.000000
 0.000000  0.192308  0.025641  0.782051
 0.217949  0.000000  0.782051  0.000000
 0.051282  0.000000  0.948718  0.000000
 0.000000  0.012821  0.000000  0.987179
 0.000000  0.025641  0.000000  0.974359
 0.987179  0.012821  0.000000  0.000000
 0.807692  0.025641  0.166667  0.000000
 0.487179  0.115385  0.205128  0.192308
 0.423077  0.038462  0.076923  0.461538
 0.115385  0.294872  0.064103  0.525641
 0.282051  0.051282  0.102564  0.564103
 0.192308  0.025641  0.128205  0.653846
 0.589744  0.128205  0.089744  0.192308
 0.628205  0.076923  0.089744  0.205128
 0.217949  0.525641  0.089744  0.166667
 0.307692  0.487179  0.051282  0.153846
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1368.1

MOTIF MA1270.1 AT3G45610
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 600 E= 0
 0.168333  0.130000  0.238333  0.463333
 0.125000  0.251667  0.085000  0.538333
 0.295000  0.185000  0.045000  0.475000
 0.531667  0.230000  0.141667  0.096667
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.001667  0.998333
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.225000  0.000000  0.000000  0.775000
 0.065000  0.091667  0.016667  0.826667
 0.215000  0.291667  0.293333  0.200000
 0.215000  0.351667  0.178333  0.255000
 0.145000  0.315000  0.095000  0.445000
 0.138333  0.163333  0.093333  0.605000
 0.148333  0.091667  0.098333  0.661667
 0.173333  0.200000  0.080000  0.546667
 0.210000  0.153333  0.091667  0.545000
 0.220000  0.153333  0.146667  0.480000
 0.128333  0.223333  0.191667  0.456667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1270.1

MOTIF MA1381.1 AT3G46070
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 202 E= 0
 0.222772  0.262376  0.069307  0.445545
 0.133663  0.450495  0.074257  0.341584
 0.386139  0.232673  0.039604  0.341584
 0.311881  0.272277  0.079208  0.336634
 0.089109  0.391089  0.069307  0.450495
 0.237624  0.316832  0.094059  0.351485
 0.044554  0.000000  0.000000  0.955446
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.990099  0.000000  0.000000  0.009901
 0.009901  0.990099  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.069307  0.648515  0.108911  0.173267
 0.207921  0.217822  0.049505  0.524752
 0.292079  0.386139  0.064356  0.257426
 0.311881  0.321782  0.079208  0.287129
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1381.1

MOTIF MA1276.1 AT3G52440
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0
 0.178631  0.343907  0.312187  0.165275
 0.779633  0.006678  0.171953  0.041736
 0.580968  0.000000  0.000000  0.419032
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.003339  0.010017  0.365609  0.621035
 0.282137  0.051753  0.330551  0.335559
 0.580968  0.080134  0.227045  0.111853
 0.460768  0.218698  0.111853  0.208681
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1276.1

MOTIF MA1242.1 AT3G57600
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 478 E= 0
 0.081590  0.646444  0.081590  0.190377
 0.100418  0.725941  0.033473  0.140167
 0.246862  0.023013  0.453975  0.276151
 0.000000  0.958159  0.012552  0.029289
 0.002092  0.997908  0.000000  0.000000
 0.725941  0.000000  0.274059  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.993724  0.000000  0.006276
 0.052301  0.000000  0.947699  0.000000
 0.043933  0.916318  0.000000  0.039749
 0.041841  0.723849  0.004184  0.230126
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1242.1

MOTIF MA1223.1 AT3G60490
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 585 E= 0
 0.341880  0.111111  0.302564  0.244444
 0.336752  0.150427  0.208547  0.304274
 0.338462  0.177778  0.123077  0.360684
 0.403419  0.070085  0.128205  0.398291
 0.126496  0.129915  0.364103  0.379487
 0.005128  0.027350  0.000000  0.967521
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.133333  0.000000  0.866667
 0.095726  0.032479  0.806838  0.064957
 0.275214  0.121368  0.552137  0.051282
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1223.1

MOTIF MA1354.1 AT4G12670
letter-probability matrix: alength= 4 w= 29 nsites= 42 E= 0
 0.000000  0.833333  0.000000  0.166667
 0.071429  0.071429  0.000000  0.857143
 0.976190  0.000000  0.000000  0.023810
 0.976190  0.000000  0.000000  0.023810
 0.928571  0.023810  0.023810  0.023810
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.095238  0.833333  0.023810  0.047619
 0.000000  0.976190  0.000000  0.023810
 0.023810  0.000000  0.023810  0.952381
 0.904762  0.000000  0.023810  0.071429
 0.952381  0.000000  0.047619  0.000000
 0.928571  0.000000  0.071429  0.000000
 0.023810  0.857143  0.000000  0.119048
 0.000000  0.928571  0.047619  0.023810
 0.142857  0.761905  0.023810  0.071429
 0.023810  0.023810  0.000000  0.952381
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.809524  0.047619  0.023810  0.119048
 0.857143  0.023810  0.047619  0.071429
 0.047619  0.833333  0.047619  0.071429
 0.166667  0.666667  0.000000  0.166667
 0.000000  0.928571  0.000000  0.071429
 0.190476  0.000000  0.000000  0.809524
 0.904762  0.071429  0.000000  0.023810
 0.952381  0.000000  0.000000  0.047619
 0.952381  0.000000  0.023810  0.023810
 0.119048  0.833333  0.000000  0.047619
 0.000000  0.928571  0.023810  0.047619
 0.000000  0.761905  0.095238  0.142857
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1354.1

MOTIF MA1237.1 AT4G16750
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0
 0.203333  0.461667  0.120000  0.215000
 0.310000  0.161667  0.276667  0.251667
 0.188333  0.376667  0.151667  0.283333
 0.170000  0.543333  0.068333  0.218333
 0.268333  0.105000  0.320000  0.306667
 0.110000  0.501667  0.078333  0.310000
 0.050000  0.823333  0.033333  0.093333
 0.610000  0.000000  0.378333  0.011667
 0.000000  0.988333  0.006667  0.005000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.016667  0.000000  0.983333  0.000000
 0.675000  0.183333  0.001667  0.140000
 0.000000  0.998333  0.000000  0.001667
 0.641667  0.023333  0.266667  0.068333
 0.295000  0.350000  0.131667  0.223333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1237.1

