MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0144.1 AAANWWTGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 728 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.133242 0.325549 0.357143 0.184066 0.344780 0.000000 0.000000 0.655220 0.350275 0.000000 0.000000 0.649725 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0144.1 MOTIF PF0077.1 AAAYRNCTG letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1036 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.477799 0.000000 0.522201 0.598456 0.000000 0.401544 0.000000 0.191120 0.178571 0.388031 0.242278 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0077.1 MOTIF PF0139.1 AAAYWAACM letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 776 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.534794 0.000000 0.465206 0.846649 0.000000 0.000000 0.153351 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.744845 0.255155 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0139.1 MOTIF PF0017.1 AACTTT letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 8768 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0017.1 MOTIF PF0108.1 AACWWCAANK letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 604 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.211921 0.000000 0.000000 0.788079 0.844371 0.000000 0.000000 0.155629 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.259934 0.375828 0.168874 0.195364 0.000000 0.000000 0.271523 0.728477 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0108.1 MOTIF PF0113.1 AACYNNNNTTCCS letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 412 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.150485 0.000000 0.849515 0.655340 0.148058 0.099515 0.097087 0.038835 0.864078 0.046117 0.050971 0.652913 0.196602 0.109223 0.041262 0.230583 0.201456 0.075243 0.492718 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.924757 0.075243 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0113.1 MOTIF PF0063.1 AAGWWRNYGGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 536 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.828358 0.000000 0.000000 0.171642 0.177239 0.000000 0.000000 0.822761 0.141791 0.000000 0.858209 0.000000 0.082090 0.069030 0.776119 0.072761 0.000000 0.688433 0.000000 0.311567 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0063.1 MOTIF MA0265.1 ABF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.110000 0.410000 0.040000 0.440000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.410000 0.170000 0.220000 0.200000 0.220000 0.240000 0.260000 0.280000 0.390000 0.160000 0.280000 0.170000 0.340000 0.180000 0.200000 0.280000 0.400000 0.210000 0.240000 0.150000 0.418367 0.000000 0.581633 0.000000 0.118812 0.247525 0.089109 0.544554 0.000000 0.000000 0.810000 0.190000 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.000000 0.450000 0.090000 0.460000 0.370000 0.220000 0.180000 0.230000 0.340000 0.180000 0.140000 0.340000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0265.1 MOTIF MA0570.1 ABF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 44 E= 0 0.000000 0.090909 0.727273 0.181818 0.181818 0.045455 0.636364 0.136364 0.431818 0.363636 0.000000 0.204545 0.000000 0.795455 0.181818 0.022727 0.977273 0.000000 0.022727 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.863636 0.136364 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.386364 0.318182 0.204545 0.090909 0.136364 0.545455 0.204545 0.113636 0.295455 0.136364 0.477273 0.090909 0.454545 0.250000 0.250000 0.045455 0.272727 0.431818 0.295455 0.000000 0.295455 0.272727 0.386364 0.045455 0.227273 0.136364 0.522727 0.113636 0.295455 0.204545 0.454545 0.045455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0570.1 MOTIF MA0266.1 ABF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.180000 0.390000 0.250000 0.180000 0.090000 0.090000 0.020000 0.800000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.940594 0.019802 0.019802 0.019802 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0266.1