MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0047.1 Hoxa11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.250000 0.210000 0.140000 0.400000 0.490000 0.120000 0.200000 0.190000 0.540000 0.150000 0.140000 0.170000 0.430000 0.100000 0.270000 0.200000 0.100000 0.050000 0.850000 0.000000 0.000000 0.020000 0.000000 0.980000 0.020000 0.970000 0.000000 0.010000 0.260000 0.000000 0.740000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.838384 0.000000 0.000000 0.161616 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.980000 0.010000 0.000000 0.010000 0.600000 0.090000 0.090000 0.220000 0.212121 0.404040 0.111111 0.272727 0.290000 0.220000 0.250000 0.240000 0.150000 0.150000 0.310000 0.390000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0047.1