MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0143.1 Sox2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 667 E= 0
 0.040480  0.665667  0.133433  0.160420
 0.029895  0.677130  0.032885  0.260090
 0.488789  0.010463  0.005979  0.494768
 0.002990  0.014948  0.010463  0.971599
 0.020927  0.001495  0.008969  0.968610
 0.056801  0.124066  0.790732  0.028401
 0.127246  0.005988  0.013473  0.853293
 0.095808  0.290419  0.115269  0.498503
 0.612613  0.186186  0.057057  0.144144
 0.039039  0.058559  0.039039  0.863363
 0.040602  0.115789  0.667669  0.175940
 0.048120  0.634586  0.126316  0.190977
 0.641566  0.061747  0.054217  0.242470
 0.551205  0.100904  0.236446  0.111446
 0.730422  0.090361  0.091867  0.087349
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.1

MOTIF MA0143.2 Sox2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 669 E= 0
 0.040359  0.666667  0.133034  0.159940
 0.029895  0.678625  0.032885  0.258595
 0.491779  0.008969  0.004484  0.494768
 0.002990  0.014948  0.008969  0.973094
 0.020927  0.000000  0.008969  0.970105
 0.053812  0.124066  0.793722  0.028401
 0.127246  0.005988  0.011976  0.854790
 0.094311  0.291916  0.113772  0.500000
 0.611111  0.187688  0.057057  0.144144
 0.039039  0.055556  0.039039  0.866366
 0.039098  0.115789  0.669173  0.175940
 0.046617  0.636090  0.126316  0.190977
 0.641566  0.063253  0.055723  0.239458
 0.552711  0.100904  0.234940  0.111446
 0.732628  0.090634  0.089124  0.087613
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.2

MOTIF MA0143.3 Sox2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1476 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.453252  0.000000  0.000000  0.546748
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.283875  0.201220  0.514905
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0143.3