MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0014.1 Pax5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 12 E= 0 0.333333 0.083333 0.333333 0.250000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.250000 0.250000 0.166667 0.083333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.583333 0.166667 0.083333 0.166667 0.166667 0.416667 0.250000 0.166667 0.000000 0.250000 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.666667 0.083333 0.500000 0.083333 0.250000 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.666667 0.083333 0.083333 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.083333 0.000000 0.333333 0.583333 0.500000 0.083333 0.416667 0.000000 0.416667 0.083333 0.416667 0.083333 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0014.1 MOTIF MA0014.2 PAX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 896 E= 0 0.291295 0.254464 0.371652 0.082589 0.351562 0.065848 0.247768 0.334821 0.343750 0.033482 0.609375 0.013393 0.273438 0.165179 0.375000 0.186384 0.000000 0.188616 0.507812 0.303571 0.043527 0.821429 0.000000 0.135045 0.854911 0.023438 0.092634 0.029018 0.169643 0.181920 0.594866 0.053571 0.010045 0.600446 0.039062 0.350446 0.194196 0.467634 0.328125 0.010045 0.604911 0.008929 0.383929 0.002232 0.599330 0.018973 0.206473 0.175223 0.000000 0.239955 0.757812 0.002232 0.003348 0.838170 0.018973 0.139509 0.353795 0.018973 0.602679 0.024554 0.170759 0.045759 0.172991 0.610491 0.251116 0.006696 0.735491 0.006696 0.655134 0.036830 0.247768 0.060268 0.169643 0.744420 0.027902 0.058036 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0014.2 MOTIF MA0014.3 PAX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1412 E= 0 0.382436 0.126771 0.409348 0.081445 0.442635 0.104816 0.250708 0.201841 0.012748 0.106941 0.871813 0.008499 0.012748 0.903683 0.024079 0.059490 0.078612 0.024788 0.880312 0.016289 0.066572 0.062323 0.021246 0.849858 0.011331 0.026204 0.959632 0.002833 0.880312 0.027620 0.049575 0.042493 0.022663 0.924221 0.040368 0.012748 0.048867 0.765581 0.083569 0.101983 0.266997 0.286827 0.220963 0.225212 0.186261 0.285411 0.254249 0.274079 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0014.3